酵母RNA提取试剂盒
酵母RNA提取试剂盒 EASYspin
试剂盒组成、储存、稳定性:
试剂盒组成 | 保存 | 50次 |
缓冲液SE | 室温 | 30 ml |
Lytic Enzyme | -20℃ | 2.5 ml |
裂解液RLT | 室温 | 20 ml |
去蛋白液RW1 | 室温 | 40 ml |
漂洗液RW | 室温 | 10 ml |
RNase-free H2O | 室温 | 10 ml |
RNase-free 吸附柱RA和收集管 | 室温 | 50套 |
本试剂盒按照指示储存12个月不影响使用效果。
储存事项:
1. 所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。
2. 不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。
3. Lytic Enzyme为蜗牛酶甘油储液,因此比较粘稠,请小心取用,-20℃保存。 蜗牛酶是从蜗牛的嗦囊和消化道中制备的混合酶,它含有纤维素酶,果胶酶,淀粉酶,蛋白酶等20多种酶。适合破碎溶解各种酵母的细胞壁。
4. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
v 产品介绍:
酵母细胞经lytic Enzyme处理去除细胞壁后,独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,然后用乙醇调节结合条件后,RNA选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的RNase free H20将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。
v 产品特点:
1. 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。
2. 不需要使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
3. 快速,简捷,单个样品操作一般可在20分钟内完成。
4. 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.9~2.0,基本无DNA残留,可用于RT-PCR,Northern-blot和各种实验。
v 注意事项
1. 第一次使用前请先在漂洗液RW瓶中加入指定量乙醇,加入后请及时打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
2. 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。
3. 需要自备乙醇,β-巯基乙醇,水浴锅。
4. 裂解液RLT 和去蛋白液RW1中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
5. 关于DNA 的微量残留:
一般情况下,一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留,本公司的EASYspin系列RNA提取产品,由于采取了本公司独特的缓冲体系和选择了特殊吸附能力的吸附膜,在大多数RT-PCR 扩增过程中极其微量的DNA残留(一般电泳EB染色紫外灯下观察不可见)影响不是很大, 如果要进行严格的mRNA表达量分析如荧光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:
1) 选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接区,这样DNA就不能作为模板参与扩增反应。
2) 选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。
3) 将RNA提取物用RNase-free的DNase I 处理。本试剂盒还可以用于DNase I处理后的RNA清洁(cleanup),请联系我们索取具体操作说明书。
4) 在步骤去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上进行DNase I处理。请联系我们索取具体操作说明书。
6. RNA 纯度及浓度检测:
完整性:RNA 可用普通琼脂糖凝胶电泳 (电泳条件:胶浓度1.2%;0.5×TBE电泳缓冲液;150v,15 分钟)检测完整性。由于细胞中70%-80%的RNA 为rRNA,电泳后UV 下应能看到非常明显的rRNA 条带。动物rRNA 大小分别约为5 kb 和2kb,分别相当于28S 和18S rRNA。动物RNA 样品中最大rRNA 亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0 倍,否则表示RNA 样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。
纯度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA,OD260/OD280 读数(10mMTris, pH7.5)在1.9-2.2 之间。OD260/OD280 读数受测定所用溶液的pH 值影响。同一个RNA 样品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中测出的OD260/OD280 读数1.8-2.1 之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9 之间,但这并不表示RNA 不纯。
浓度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free 水稀释n 倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD260, OD280 测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/μl)= (OD260)×(稀释倍数n)×40
v 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:
ð 第一次使用前请先在漂洗液RW瓶中加入指定量无水乙醇!
ð 操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。
ð 吸取使用量的缓冲液SE加入0.2%β-巯基乙醇备用。
1. 小量酵母培养细胞
a. 收集1ml (约107细胞)处于对数生长期酵母培养物到1.5ml离心管, 12,000 rpm离心30秒,尽可能吸弃上清。
b. 加入100μl缓冲液SE中(确认已经加入β-巯基乙醇至终浓度0.2%),轻柔吹打充分重悬细胞;根据酵母量加入约20μl Lytic Enzyme储液,充分颠倒混匀,37℃温育15-30分钟消化细胞壁,中间可颠倒数次帮助消化。
如果破壁效果不好导致产量低,可以加大lytic Enzyme 用量来提高酶工作浓度,还可以延长消化时间或者提高温度到45℃来提高效果,不适合Lytic Enzyme消化的酵母可选用其它方法如0.5mm玻璃珠涡旋击打 ,反复冻融等。
c. 加入380μl裂解液RLT(确认已经加入β-巯基乙醇至终浓度1%),吹打混匀后用手剧烈振荡20秒,充分裂解。
一般加入裂解液后充分涡旋吹打后应该见不到明显团块或者不溶物,极少数情况下如果有明显团块或者不溶物可以将裂解物13,000rpm离心3分钟,沉淀不能裂解的碎片或者不溶物, 将裂解物上清全部转到一个新离心管再进行下一步。
d. 加入280μl 96-100%乙醇,立即吹打混匀,不要离心。
e. 接操作步骤项下3。
2. 中量酵母培养细胞
a. 收集2-3ml (约3X107细胞)处于对数生长期酵母培养物到1.5ml离心管(超过1.5ml可分两次在同一个离心管内进行收集细胞),12,000rpm离心30秒,尽可能吸弃上清。
b. 加入300μl缓冲液SE中(确认已经加入β-巯基乙醇至终浓度0.2%),轻柔吹打充分重悬细胞;根据酵母量加入50μl Lytic Enzyme储液,充分颠倒混匀,37℃温育15-30分钟消化细胞壁,中间可颠倒数次帮助消化。
如果破壁效果不好导致产量低,可以加大lytic Enzyme 用量来提高酶工作浓度,还可以延长消化时间或者提高温度到45℃来提高效果,不适合Lytic Enzyme消化的酵母可选用其它方法如0.5mm玻璃珠涡旋击打 ,反复冻融等。
c. 13,000 rpm离心1分钟,尽可能吸弃上清。
d. 加入350μl裂解液RLT(确认已经加入β-巯基乙醇至终浓度1%),吹打混匀后用手剧烈振荡20秒,充分裂解。
一般加入裂解液后充分涡旋吹打后应该见不到明显团块或者不溶物,极少数情况下如果有明显团块或者不溶物可以将裂解物13,000rpm离心3分钟,沉淀不能裂解的碎片或者不溶物, 将裂解物上清全部转到一个新离心管再进行下一步。
e. 加入等体积70%乙醇(DEPC水配制,约350μl)立即吹打混匀,不要离心。
f. 接操作步骤项下3。
3. 将混合物加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心30-60秒,弃掉废液。
4. 加700μl 去蛋白液RW1,室温放置30秒,12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。
如果DNA残留明显,可在加入RW1后室温放置5分钟再离心。
5. 加入500μl漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl漂洗液RW,重复一遍。
6. 将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
7. 取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加热可提高产量), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。
8. 如果预期RNA产量>30μg,加30-50μl RNase free water重复步骤7, 合并两次洗脱液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。
洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。