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真菌基因组DNA快速提取试剂盒

真菌基因组DNA快速提取试剂盒

真菌基因组DNA快速提取试剂盒

                               CAT:0440-50T

试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

50

100

200

RNase A(10mg/ml)

-20

250 μl

500 μl

1 ml

缓冲液AP1

室温

25 ml

50 ml

100 ml

缓冲液AP2

室温

10 ml

20 ml

40 ml

缓冲液AP3/E

室温

15 ml       25 ml       50 ml
 
第一次使用前按说明加指定量乙醇

漂洗液WB

室温

15 ml       25ml          50ml
 
第一次使用前按说明加指定量乙醇

洗脱缓冲液EB

室温

15 ml

20 ml

40 ml

吸附柱AC

室温

50

100

200

收集管(2ml

室温

50

100

200

本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

 

储存事项:

1.       缓冲液AP1AP3/E低温时可能出现析出和沉淀,可以在65水浴几分钟帮助重新溶解(AP3加入乙醇前可加热,加入乙醇后不可加热),恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。

2.       避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

v  产品介绍:

该试剂盒采用DNA吸附柱和新型独特的溶液系统,适合于从真菌组织细胞中快速简单地提取基因组DNA。可在30分钟内完成一个或多个100mg新鲜或20mg干燥的真菌样品DNA的纯化工作。提取过程不需要用到有毒的酚氯仿等有机物抽提,也不需要用到耗时的异丙醇或乙醇沉淀,并能快速高效地去除多糖类、酚类和酶抑制物等杂质,纯化的DNA可直接用于PCR、酶切和杂交等实验。

新鲜或干燥的真菌组织(细胞)磨碎后经裂解液裂解;蛋白质、多糖、细胞残片被沉淀去除;然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 进一步将多糖,多酚和细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。

 

v  产品特点:

1.       离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。

2.       不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

3.       快速,简捷,单个样品操作一般可在1小时内完成

4.       数种去多糖、多酚成份和多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.71.9,可直接用于PCRSouthern-blot和各种酶切反应。

 

v  注意事项

1.       所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13000 rpm的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。

2.       开始实验前将需要的水浴先预热到65备用。

3.       缓冲液AP3/E中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

4.       不同来源的真菌组织细胞材料中提取DNA 的量会有差异,一般100mg新鲜组织典型产量可达3-25μg

5.       洗脱液EB不含有螯合剂EDTA 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱, 但应该确保pH大于7.5 pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱 10mM Tris-HCl 1mM EDTApH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。

6.       真菌种类复杂,没有一种试剂盒可以提取所有种类的真菌DNA如果有的真菌多糖多酚含量过于丰富、次级代谢产物太复杂导致本试剂盒效果不佳,可以选择本公司的0419-50CBCTAB法植物DNA提取试剂盒提取真菌,一般该试剂盒对于多糖多酚次级代谢产物复杂的真菌DNA提取效果良好。

 

v  操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)

提示:

ð 第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!

ð 第一次使用前请先在缓冲液AP3/E中加入指定量无水乙醇!

1.       取适量真菌组织在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。

2.       转移细粉(新鲜真菌组织100 mg 或干重组织20 mg)到一个1.5ml离心管,不要解冻,加入400μl缓冲液AP1 4μl RNase A(10 mg/ml),旋涡振荡,充分混匀帮助裂解。

如果组织裂解困难,可根据需要加一个轻柔匀浆10秒的步骤帮助裂解。大多数情况下不需要离心去除未完全裂解的组织,因为后面有一个离心去除的步骤。

可选:多糖含量特别高的时候可以在AP1加入20ul多糖清除剂; 多酚含量特别高的时候可以在AP1中加入0.2% beta巯基乙醇。也可两者同时加入。

3.       65水浴10分钟,在水浴过程中颠倒离心管2-3次,混合样品。

4.       加入130 μl 缓冲液AP2,充分混匀,冰上放置5分钟, 14,000 rpm 离心5-10 分钟,小心吸取上清到一个新的1.5ml离心管,注意不要吸到界面物质。

5.       计算上清量,加入1.5倍体积的AP3/E请先检查是否已加入无水乙醇!),立即吹打混匀。

加入AP3/E可能会出现絮状沉淀,但不影响DNA提取。注意将AP3/E直接加入到上清并立即吹打混匀。

6.       将上一步所得混合物(包括可能出现的沉淀)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心30-60秒,倒掉收集管中的废液(先加650μl离心,弃废液,再加入剩余的溶液,再次离心)。

7.       加入600μl漂洗液WB请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。

8.       加入600μl漂洗液WB12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。

9.       将吸附柱AC放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

10.     取出吸附柱AC放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位100μl洗脱缓冲液EB 室温放置3-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟。将得到的溶液重新加入吸附柱中,室温放置2分钟,12,000 rpm离心1分钟。

洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果预计和需要产量高,可增大洗脱体积,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于50μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。

11.     DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20

v  问题与解决方法

问题

评论与建议

DNA产量低

*处理材料过量或者裂解不完全-建议:使用适量的起始材料,充分研磨或者匀浆

*结合条件不恰当-建议:步骤5精确估计上清量,加入1.5倍体积AP3/E量要准确

RNA残留

*真菌RNA含量太丰富-建议:提高RNase A处理浓度

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘记加无水乙醇-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。

离心柱堵塞

*研磨裂解不充分,团块多;裂解物太粘稠;离心力太小-建议:参见步骤2,加一个离心步骤去除;减低起始材料量,不要处理过量,加大离心力

洗脱下来的
  DNA溶液带颜色
  或者膜上有明显
  的色素残留

*漂洗次数不够-建议:步骤8完成后,加500μl乙醇再漂洗一遍

*起始材料太多过量-建议:减少起始处理材料,不要过量

洗脱下来的
  DNA产量低

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇-建议:确保做了步骤9,否则残留乙醇会影响洗脱效率。

*使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液-建议:仔细阅读步骤10和注意事项5和只使用洗脱缓冲液EB洗脱。

*洗脱缓冲液量偏低-建议:使用200μl洗脱缓冲液洗脱

A260吸光值
  异常偏高

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

DNA下游酶切
  不能切开或者
  酶切不完全

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应-建议:确保做了步骤9,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。