TRIpure总RNA快速提取试剂盒
TRIpure总RNA快速提取试剂盒(柱式法)
用于各种动物组织、细胞的总RNA提取
样本容量大,适用类型多,优秀的纯度和产量
使用DNase I柱上消化DNA,彻底去除基因组DNA残留
◇产品编号:HYY0420-50
◇常温运输、保存(15-25℃)
◇本产品仅供科研使用
一、产品概述:
本试剂盒使用TRIpure Reagent作为裂解液,具有样本容量大、适用类型多的特点,同时使用吸附柱捕获RNA,相比单独使用TRIzol试剂和异丙醇沉淀,不但能进一步提高RNA纯度,还能简化流程,节省大量的操作时间,非常适合一次性从大量组织或细胞中提取总RNA(例如转录组测序前的RNA制备)。提取过程中使用DNase I在吸附柱上消化DNA,彻底去除基因组DNA残留。
对于常见的组织或细胞,也可以使用组织细胞RNA快速提取试剂盒,不但拥有更简化的操作流程,同样可以提供优秀的RNA纯度和产量,并可以避免使用氯仿。但对于肌肉、心脏、肝脏一类的样本,仍然建议使用TRIpure Reagent总RNA快速提取试剂盒。
二、规格及组成:
组 分 | (50rxn) | |
TRIpure Reagent | 50 ml | (2-8℃避光保存) |
70%乙醇 | 30 ml | |
去蛋白液RW1 | 40 ml | |
漂洗液 | 50 ml | |
RNase-free H2O | 10 ml | |
RNA吸附柱 | 50个 | |
使用手册 | 1份 | |
■Recombinant DNase I (1U/μl) | 350 U | (选配) |
■DNase I Buffer | 3 ml | (选配) |
■漂洗液 | 50 ml | (选配) |
■漂洗液RW2 | 30 ml | (选配) |
自备试剂 | 氯仿或二氯甲烷 |
三、注意事项:
1. TRIpure Reagent可以常温运输,收到后建议在2-8℃避光保存。
2. TRIpure Reagent含有酚,接触皮肤会导致灼伤,去蛋白液RW1和漂洗液RW2中含有刺激性化合物,建议操作时戴乳胶手套、口罩及护目镜,避免沾染皮肤和衣服。若不慎沾染皮肤、眼睛时,用大量清水或生理盐水冲洗,必要时及时就医。
3. 开封后的RNase-free H2O不能再次标识为无菌状态,为避免存储过程中微生物滋生,建议装入自封袋后在2-8℃保存,必要时可以使用新的RNase-free H2O进行洗脱。
4. 在RNA提取过程中应使用无酶的离心管及耗材,防止因耗材污染导致RNA降解。
5. 对于公用的电泳槽及制胶板,在进行RNA电泳前应进行清洗,防止RNA在电泳过程中降解而误判RNA提取失败。推荐使用固相RNase清除剂。
6. 经常清洁离心机转子及腔室,防止残留液体形成气溶胶污染;使用离心管离心时,禁止开盖离心。
7. 为确保离心参数稳定,本手册使用相对离心力来标定离心机的转数,如”室温,12,000×g 离心5min” 表示在当前温度下离心5min,离心机在对应转速下产生的相对离心力约为12,000倍地球引力。通常在离心机上被标识为“RCF”(Eppendorf)或“×g”(Thermo)。
8. 对于在-80℃或液氮中保存的样本,直接在室温下称重会引起RNA降解,可以根据样本的体积来估算样本的重量,样本的分割和取样需要在干冰冰面上进行,所用的离心管、镊子、剪刀等工具也需要在干冰上提前降温,整个过程需要严格防止样本发生解冻。推荐在取样时就使用RNA样品保存液处理样本,处理后的样本可以在常温下分割、取样,不会影响最终RNA的完整性。
五、使用方法:
1. 根据不同类型的组织,参考下列三种方法来破碎并裂解样本:
▲组织
每50-100mg组织中加入1ml TRIpure Reagent,用匀浆器或研磨仪破碎组织样品,充分释放组织中的RNA。推荐使用研磨仪在室温下研磨破碎组织,可以避免样本间的交叉污染。组织样品的体积不能超过TRIpure Reagent 体积的10%。
▲单层生长的细胞
直接在直径87.5px的培养板中加入1ml TRIpure Reagent,通过移液器反复吹打混匀来裂解细胞。TRIpure Reagent的用量由培养板的面积决定(每250px2加1ml TRIpure Reagent),而不是依据细胞的数量。一般情况下,普通大小的细胞培养瓶,加入1ml TRIpure Reagent,迅速轻摇使TRIpure Reagent充分和瓶底所有细胞接触,用移液器反复吹打混匀来达到裂解细胞并灭活RNA酶的目的。当TRIpure Reagent的用量不足时,可能会导致最终的RNA中有DNA污染。
▲悬浮生长的细胞
通过离心来沉淀并收集细胞。每5-10×106个动物细胞、植物细胞、酵母菌细胞或每1×107个细菌加1ml TRIpure Reagent,用移液器反复吹打来裂解细胞。在加入TRIpure Reagent前应避免洗涤细胞,否则会增加mRNA降解的可能性。在裂解某些酵母菌、细菌时,可能需要使用匀浆器。
2. 在15-30℃条件下孵育5min,以便使核蛋白体完全分解。
3. 可选步骤:在4℃条件下,12,000×g 离心5-10min,去除匀浆液中不溶解的物质,转移上清液到新的离心管中。
注意:对于富含蛋白质、脂肪、细胞外物质的样本(例如肌肉、脂肪组织)建议增加本操作步骤。离心后,RNA仍然保留在上清液中,剩下的沉淀中含有细胞外膜、多糖、以及高分子量DNA,应该将清澈的匀浆液转移到干净的试管中,再加入氯仿进行后续的分离步骤。在处理脂肪组织的样品时,大量的脂肪会漂浮在最上层,这些脂肪也应该被去掉。
4. 在每1ml TRIpure Reagent中加入0.2ml氯仿,盖紧盖子,剧烈振荡30秒,室温下孵育2~3分钟。
5. 在4℃条件下,12,000×g 离心5-10min。沉淀细胞碎片和杂质。
正常现象:
离心结束后,溶液会分为三层:粉红色的下层有机相、白色的中间层和无色透明的上层水相。水相的体积约占加入TRIpure Reagent体积的60%。
异常现象:
a.上清液比较浑浊,通常与样本过量有关,在取出上清液后可以加入400μl氯仿重新抽提一次;
b.下层有机相为无色,上层水相仍为粉红色,通常与加入氯仿后未彻底混匀有关,再次振荡并离心。
6. 小心吸取400-500μl上层水相到RNase-free离心管中,避免吸入中间层的杂质。
7. 加入等体积的70%乙醇,立即吹打或涡旋混匀。
正常现象:
加入70%乙醇后,液体仍然保持清澈透明,不会出现浑浊或析出絮状沉淀。
异常现象:
混匀后出现浑浊或析出絮状沉淀,通常在提取肝脏样本时出现,并可能使用了过多的样本。如果已经影响到最终RNA的纯度,重复提取时可以适当减少样本用量。
8. 将上述混合物(每次最多700μl,请分多次进行离心)加入到一个RNA吸附柱中,室温,12,000×g 离心1min,弃掉收集管中的废液。
正常现象
通常,液体在上述离心条件下可以全部过滤,若有未过滤的液体,再次离心2-3min即可全部过滤。
异常现象:
a.液体难以过滤,延长离心时间至3min,仍有液体残留。可能与样本含有多糖(例如肝脏)或较多的蛋白质有关,这些大分子在吸附膜表面出现堆积或黏附,堵塞了吸附膜的孔隙而引起过滤困难。重复提取时可以适当减少样本用量;
b.吸附柱的塑料内圈位置出现明显的沉淀堆积或杂质。
9. 加入700μl去蛋白液RW1,静置30秒,室温,12,000×g 离心1min,弃掉收集管中的废液。
10. 吸附柱上消化DNA:(可选步骤)
注意:对于大多数正常用量的样本,在步骤9结束后,吸附膜上通常只残留非常少的基因组DNA。如果后续实验已经包含DNase消化步骤或进行oligo dT吸附,则此处的“吸附柱上消化DNA”的步骤可以省略,直接进行步骤11。
10.1 加入700μl漂洗液,室温,12,000×g 离心1min,弃掉收集管中的废液。
10.2 室温,12,000×g 离心2min。此步非常重要,否则残留的乙醇会抑制DNase I的活性。
10.3 将5-6μl的Recombinant DNase I加入到45-44μl DNase I Buffer中吹打混匀配制成50μl的DNase I工作液,然后将50μl的DNase I工作液滴加到吸附柱的膜上,室温静置15-20min。
10.4 加入600μl漂洗液RW2,室温,12,000×g 离心1min,弃掉收集管中的废液。
11. 加入500μl漂洗液,室温12,000×g 离心1min,弃滤液。加入500μl漂洗液,再漂洗一次。
12. 将RNA吸附柱放回空的收集管中,室温,12,000×g 离心2min。
注意:此步非常重要,否则残留的乙醇会影响RNA的使用。
13. 将RNA吸附柱放入一个RNase-free离心管中,直接在吸附膜的中间部位加50-100μl (推荐50-70μl)RNase-free H2O,室温放置3-5min。
14. 室温,12,000×g 离心2min。离心管中溶液即为RNA样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
六、常见问题及解决办法:
常见问题 | 原 因 | 解决方案 |
RNA产量低 | 样品研磨不充分 | 1. 匀浆或研磨时,确保样本完全破碎,没有较大的组织或颗粒。 |
组织本身RNA含量少 | 1. 不同类型的组织和细胞有不同含量的RNA,对于含量少的组织可以适当提高起始处理量。 | |
RNA降解 | 样本保存方法不当 | 1. 使用新鲜样本或经液氮速冻后保存于-80℃的样本,样本保存期间,防止超低温冰箱反复升温。 |
样本反复冻融 | 1. 保存样本时,建议按一次提取用量分装在研磨管中,并加入研磨珠,避免因反复冻融导致的降解。 2. 推荐在取样时就使用华越洋无液氮DNA/RNA样品常温保存液处理样本,处理后的样本可以在常温下分割、取样,也可以再次放回低温下保存,不会影响最终RNA的完整性。 | |
电泳槽、制胶板或者电泳缓冲液受污染 | 1. 如果电泳槽、制胶板出现RNase污染,建议使用华越洋外源RNase清除剂处理; 2. 使用RNase-free Water配制电泳缓冲液。 | |
使用的耗材存在RNase污染 | 1. 提取过程中使用无RNase的吸头、离心管。 |