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大型/大量质粒提取试剂盒

大型/大量质粒提取试剂盒

 

大型/大量质粒提取试剂盒

目录号:PL1401

v  适用范围:

用于大量高纯或者转染级质粒制备和BAC/PAC大型质粒制备

v  试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

20

RNaseA10mg/ml

-20℃

1.3ml

溶液P1

4℃

130ml

溶液P2

室温

100 ml

溶液P

室温

110 ml

杂质清除剂A

室温

3 ml

杂质清除剂B

室温

30 ml

内毒素清除剂

-20℃

10 ml


本试剂盒在室温储存18个月不影响使用效果。

储存事项:

1.       第一次使用时,将试剂盒所带全部的RNase A加入溶液P1后(终浓度100μg /ml)置于4℃保存。如果溶液P1RNase A失活,提取的质粒可能会混杂有微量RNA残留,在溶液P1中补加RNase A即可。

2.       内毒素清除剂在4℃可保存一个月,如果要长期保存,建议保存在-20℃!

3.       环境温度低时溶液P2SDS可能会析出出现浑浊或者沉淀,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清,不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。

4.       避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子

v  产品介绍:

本试剂盒用碱裂解法从培养菌中提取质粒DNA,采用独特的溶液配方和内毒素清除试剂,只需要几次简单离心去除蛋白质、多糖、内毒素、RNA等杂质,获得高质量的质粒DNA。纯化DNAOD260/280通常在1.8左右,得到的质粒可直接应用于细胞转染甚至动物体内实验等对DNA纯度要求很高的工作中。纯化后期过程均在1.5ml小离心管中操作,方法简单,不需特殊设备,无需过柱,不用酚氯仿抽提;基本可完全回收细菌裂解释放出的质粒,不必担心质粒DNA的丢失。本方法提取纯化质粒DNA,对质粒损伤小,即使是10kb甚至100kb以上的大型质粒或超大型BAC/PAC质粒,只要碱裂解法能够提取,就可以有效纯化。可选择任意小体积溶解质粒,浓度可高达5μg/μl。超螺旋比例可高达95%,无内毒素,转染效果好。

v  产品特点:

1.       不需要使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀。快速、 方便、从150-200 ml大肠杆菌LB((Luria-Bertani)培养液中,可快速提取0.5-2mg纯净的高拷贝质粒DNA,提取率达80-90 %

2.       获得的质粒产量高,超螺旋比例可高达95%,浓度可达5μg/μl纯度好,可直接用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序等各种分子生物学实验。

3.       内毒素含量极低(< 0.1EU/μg DNA),可直接应用于细胞转染

v  注意事项

1.       提取的质粒量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb 的大质粒,应加大菌体使用量,同时按比例增加P1P2P的用量。

2.       提取大质粒时操作动作要轻柔,应该使用剪大了开口的吸头,防止机械剪切对DNA的损坏。

3.       DNA沉淀液沉淀离心后,可能看不到明显沉淀。如未见沉淀,担心DNA丢失,可保留上清液,待完成全部操作后电泳鉴定,以确定是否获得终产物(数百微克DNA离心沉淀在管的侧壁上,可能无法看到明显团块)。

4.       得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260值为1相当于大约50μg/ml DNA电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA条带,这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过95%

5.       质粒DNA确切分子大小, 必须酶切线性化后,对比DNA分子量Marker才可以知道。处于环状或者超螺旋状态的质粒,泳动位置不确定,无法通过电泳知道确切大小。

 

v  操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)

ð  提示:RNase A全部加入溶液P1中,混匀,使用后置于2-8℃保存。

1.       取过夜培养菌150 ml左右菌液(最大不超过180ml-200ml),装入合适的离心瓶中,10,000 x g4℃离心2 min沉淀菌体,完全弃除上清。

2.       加入5 ml 溶液P1,充分混悬震荡菌体沉淀,使其完全分散开,至无絮块存在。细菌悬液移入50 ml离心管中,室温放置3~5 min  

如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。

3.       加入5 ml 溶液P2,轻轻颠倒离心管6~8次,室温放置4-5 min,使细菌完全裂解,溶液透明

温和地混合,不要剧烈震荡,以免基因组DNA剪切断裂!所用时不应超过5分钟!以免质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要准确的5分钟。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,应减少菌体量。

4.       5 ml溶液P,立即颠倒离心管6~8次,充分混匀,至白色絮状物产生。上述裂解液于4℃ 12,000~16,000 x g离心10~15 min,小心吸出上清,移入新的50 ml离心管中。

加入溶液P后应该立即混匀,以免产生SDS的局部沉淀。

5.       加入10 ml 异丙醇,颠倒离心管,充分混匀。

注意: 使用异丙醇沉淀,蛋白杂质和盐离子共沉淀较少,可能看不到明显的较大团块沉淀,但是质粒还是可以完全沉淀下来,不影响实际的质粒产量。如果你习惯看见较大的沉淀团块操作,可以选择2倍体积的无水乙醇沉淀。

6.       4℃ 12,000~16,000 x g离心10 min,小心弃去上清,倒置于吸水纸上轻轻沥干残余液体,加入3-5ml 70%乙醇漂洗一遍,最高速离心5分钟,弃上清,晾干沉淀。

DNA沉淀如果干燥过头,DNA将无法完全溶解,但是如果乙醇没有晾干挥发干净,残留太多,也会造成DNA无法完全溶解。

注意:异丙醇离心沉淀后,质粒纯度很高吸附在管底和侧壁可能看不见沉淀,但是不影响产量,后续步骤仔细吹打管底和沉淀所在的侧壁涮洗溶解质粒。

7.       加入1.4 ml 溶液P1完全溶解沉淀团块,注意附着在管底和侧壁上的质粒沉淀虽然可能看不见,也要吹打管底和沉淀所在的侧壁涮洗下来(大质粒可用宽口吸管轻轻吹打辅助溶解)。然后将质粒溶液转入2个新的1.5 ml离心管中(每个700μl)。可选步骤(一般不需要):如果菌株RNA丰富有微量RNA残留,可在此步骤后将质粒溶液 60℃孵育15 min消化RNA

8.       每管加入55μl杂质清除液A,颠倒充分混匀后加入约0.1体积(80μl)冰预冷的内毒素清除剂,颠倒旋转7-10次(30秒左右)充分混匀,冰浴或者冰上放置>=5分钟,中间偶尔颠倒混匀几次。

内毒素清除剂加入上清后,上清会变得浑浊,但是冰浴后应恢复清亮。

注意:如果不需要去内毒素用于转染,可在此步骤只加入55μl杂质清除液A,充分混匀后冰上放置5分钟,离心后小心取上清转入一个新管,直接接步骤11

9.       42℃水浴,溶液又会变为浑浊,颠倒混匀后42℃温育5分钟。

10.     室温14,000 x g离心5 min分相(温度低时,内毒素清除剂无法分相,因此必须至少20℃以上室温离心或者保证冬季转头温度20℃以上)。上层水相含DNA,下层蓝色油状相含内毒素和其它杂质。将含DNA的上层水相转移到新管(注意不要吸到蓝色油状层,里面含内毒素等杂质),弃油状层。

溶液必须分为上下两相,否则应重复步骤9-10

11.     将上一步所得上层水相中加入等体积杂质清除液B(约750μl,轻柔混匀,4℃ 14,000 x g离心10 min,弃上清(注意不要丢失DNA),轻轻加入1 ml 70%乙醇洗涤,离心弃上清,共两次,室温倒置晾干5~10 min使乙醇完全挥发。

12.     每个离心管加适量TE或者纯水(100~200μl)溶解沉淀(可在37℃水浴中振荡以辅助溶解)。要注意很多质粒DNA可能附着在离心管侧壁上,即使看不见,也应该充分吹打侧壁溶解回收质粒DNA

最后沉淀可以根据需要选择任意小体积溶解这样可以得到很高浓度的转染级质粒DNA(高达5-10μg/μl。如果有需要,客户也可以选择更大体积溶解。