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土壤 RNA 提取试剂盒

土壤 RNA 提取试剂盒

土壤 RNA 提取试剂盒 5.0 版 (含 DNase I)

◆产品编号:ZH001BPLUS,可用一般土壤,淤泥,沙漠土等腐殖酸干扰严重的样品

◆常温运输,避光保存,试剂盒配套的 DNase-20℃ ◆仅限于实验室使用

土壤 RNA 提取试剂盒产品特点:

本试剂盒采用进口硅基质吸附材料和独特的缓冲液体系,用于快速提取各种土壤样本中的总

RNA,适合各种含有腐殖酸、富里酸等 RT-PCR 抑制因子的土壤样本。目前已成功用于堆肥、淤泥、

粪肥、园林土壤、菜地土壤、农作物土壤等样本。

本试剂盒采用独特的缓冲液体系,能高效清除土壤样本中腐殖酸、富里酸、多糖、多酚等 RT-PCR

抑制因子;结合 DNase 柱上消化技术,可以彻底去除基因组 DNA 的污染,保证最终 RNA 的产量

和纯度满足后续实验要求。离心吸附柱采用进口硅基质吸附材料,具有稳定的 RNA 吸附能力和优秀

的均一性,对 RNA 的吸附能力可达 50μg。

土壤 RNA 提取试剂盒规格及组成:

50 次包装

玻璃珠370mg×50溶液 A135 mL溶液 A2.7 mL×2

溶液 A310 mL

溶液 B15 mL

溶液 C50 mL

RNA 吸附柱50 套

漂洗液50 mL

RNase-free H2O10 mL

Recombinant DNase I (1Μ/μl) 300U(可选)

DNase I Bμffer

2.5 mL(可选)漂洗液50 mL(可选)

漂洗液 RW2

30 mL(可选,与 DNase I 配套使用)

使用手册

1 份

自备试剂、耗材

水饱和酚、氯仿、收集管、5~10ml 离心管

土壤 RNA 提取试剂使用方法:

注意:

溶液 A1 在第一次启用后或长时间不用,需在 4℃条件下存放,用前在 37℃水

10Min.

溶液 A2 在储存过程中可能会产生沉淀。若出现沉淀,经 37℃水浴 10min,使

沉淀彻底溶解,充分摇匀后即可使用。

1. 将 370mg 玻璃珠转入到一个 5~10ml 的塑料离心管中(玻璃珠已分装到 1.5mL 离心管中)。

2. 将 500mg 土壤加入到上述离心管中。

注意:

通常在堆肥、淤泥等样本中含有非常丰富的微生物和其它小型生物(如线虫等),RNA 和

DNA 的含量也会非常高。为保证 RNA 产量和纯度,建议在初次使用时,样本用量不超过 250mg,

后期可以根据实验效果适当调整样本用量。

对于比较贫瘠的土壤(如河道冲积形成的砂土等),由于微生物数量非常少,建议增加样本

用量至 1g 或 2g,同时按比例增加玻璃珠和各个溶液的用量。由于溶液体积变大,在第 12 步时

会增加液体加载的次数,此处也可以使用真空抽滤来代替离心过程,以提高操作效率,具体方

案可以咨询厂家。

3. 将 625μl 溶液 A1 加入到上述离心管中,涡旋混匀。

4. 将 62.5μl 溶液 A2 加入到上述离心管中,涡旋混匀。

5. 将 200μl 溶液 A3 加入到上述离心管中,然后将离心管固定在涡旋仪上,最大转速(3200rpm,

若涡旋仪达不到此速度,可适当延长 5~10min)涡旋连续振荡 5min。

6. 取下离心管,加入 400μl 水饱和酚和 400μl 氯仿,涡旋混匀直至分离层消失。

7. 把离心管固定在涡旋仪上,最大转速(3200rpm,若涡旋仪达不到此速度,可适当延长 5~10min)

涡旋连续振荡 10min。

8. 取下离心管,室温下 2500g 离心 10min。

注意:离心结束后,可以看到 3 个分离层:最下层有机相含有蛋白、细胞碎片;中间层含有腐殖酸及其它有机、无机成份;最上层水相含有 RNA。中间层的厚薄取决于样品类型,富含有机质

的样品会形成更厚的中间层。

9. 离心结束后,小心取下离心管,将上层水相 750μ

(最多不超过900μl)转移到一个干净的 1.5mL

离心管中,加入 1/3 体积的溶液 B,涡旋混匀,冰浴 10min。

注意:离心结束后,在上层水相的液面上仍可能有少量漂浮物(如未完全腐烂的树叶等,漂浮

物的多少与样品类型有关)。尽量避免吸入这种漂浮的杂质,若在吸取上层水相的过程中不慎吸

入少量漂浮物,可以在接下来的冰浴和离心的步骤中去除,并不会对后续操作造成影响。由于

中间层和下层有机相含有细胞碎片、蛋白质和其它有机成份,应避免吸入中间层及下层有机相。

10. 室温 12000 g 离心 3min,转移上清液到一个干净的 2mL 离心管中。离心管底部可能会出现

明显的杂质沉淀,最好留下 50μl 上清液不取。

11. 加入等体积的溶液 C,充分颠倒混匀。 

12. 将混合物(每次最多 700μl)加入到一个 RNA 吸附柱中,室温 12000g 离心 1 分钟,弃穿透

液。每个样品一般需加载 3 次。

13. 可选步骤:(膜上消化 DNA)

13.1 加入 700μl 漂洗液,室温 12000g 离心 1 分钟,弃穿透液。

13.2 室温 12000g 离心 2 分钟。此步非常重要,否则残留的乙醇会抑制 DNase 的活性。

13.3 将 5~6μl 的 Recombinant DNase I 加入到 45~44μl DNase I Bμffer 中吹打混匀配制成

DNase I 工作液,然后将 DNase I 工作液加到 RNA 吸附柱的硅胶膜上,室温放置 15~20 分钟。

13.4 加入 600μl 漂洗液 RW2,室温 12000g 离心 1 分钟,弃穿透液。

14. 加入 500μL 漂洗液,室温 12000g 离心 1 分钟,弃穿透液。加入 500μL 漂洗液,重复一遍。

注意:加入 500μl 漂洗液后,盖上盖子上下颠倒数次,可以洗去残留在吸附柱内壁及盖子上的盐。

15. 室温 12000g 离心 2 分钟。此步非常重要,否则残留的乙醇会影响 RNA 的使用。

16. 将 RNA 吸附柱转移到 RNase-free 收集管中,加入 50~100μL RNase-free H2O,室温放置 3~

5 分钟。

17. 室温 12000 g 离心 2 分钟,离心管中溶液即为 RNA 样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。

18. 如果期望 RNA 产量>30μg,另取 30~50μl RNase-free H2O 重复步骤 13 和 14,合并两次

的洗脱液;也可以将第一次的洗脱液加到 RNA 吸附柱中进行再次洗脱,这样能得到较高浓度的

RNA,但 RNA 产量会比前一种方法低 15~30%,用户根据需要进行选择。19. RNA 完整性的电泳检测:如果需要做 Northern 杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行 RNA

电泳,因为非变性胶不能分离所有的 RNA 分子(BioTechniqμes,28:414,2000)。

20. RNA 产量产率测定:将 5~10 μl RNA 溶于 TE 缓冲液中(pH7.5~8.2 之间)检测其在 OD260

的光吸收。通过光吸收可以得出 RNA 浓度(1 OD260 的 RNA=40 μg/mL),进而计算出 RNA

的产量(浓度×体积)和产率(RNA 产量/组织用量)。

21. RNA 纯度测定:无污染的总 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8~2.1 之间(具体数值与其碱

基组成和溶液成分等多种因素有关),高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质污染,但一般不影响。

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