快速高产量质粒DNA小量提取试剂盒
快速高产量质粒DNA小量提取试剂盒
- 试剂盒组成、储存、稳定性: CAT:HUAYUEYANG9381
试剂盒组成 |
保存 |
100次 |
200次 |
平衡液 |
室温 |
10 ml |
20 ml |
RNase A(10mg/ml) |
4℃ |
250 µl |
500 µl |
溶液P1 |
4℃ |
25 ml |
50 ml |
溶液P2 |
室温 |
25 ml |
50 ml |
溶液N3 |
室温 |
25 ml |
50 ml |
去蛋白液PE |
室温 |
31.5 ml |
63 ml |
第一次使用前按说明加指定量乙醇 |
|||
漂洗液WB |
室温 |
25 ml |
50 ml |
第一次使用前按说明加指定量乙醇 |
|||
洗脱缓冲液EB |
室温 |
15ml |
20 ml |
吸附柱AC |
室温 |
100个 |
200个 |
收集管(2ml) |
室温 |
100个 |
200个 |
本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
储存事项:
- RNase A保存在即用型甘油缓冲液中,常温运输,收到后,不超过25℃室温至少保存6个月,4℃保存12个月,长期保存放-20℃。
- 第一次使用时,将试剂盒所带的全部RNase A加入溶液P1后(终浓度100ug/ml)置于2-8℃保存。如果溶液P1中RNase A失活,提取的质粒可能会有微量RNA残留,在溶液P1中补加RNase A即可。
- 环境温度低时溶液P2中SDS可能会析出浑浊或者沉淀,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清,不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。
避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
- 产品介绍:
本试剂盒采用独特的高产量SDS-碱裂解法配方裂解细胞,质粒产量提高1-2倍。离心吸附柱内的硅基质膜在高盐、低pH值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐、高pH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。
- 产品特点:
- 特殊改进的高产量缓冲液配方可以把质粒产量提高1-2倍。
- 独有的去蛋白液配方,可以高效去除残留的核酸酶,即使是核酸酶含量丰富的菌株如JM系列、HB101也可以轻松去除。有效防止了质粒被核酸酶降解。
- 快速、方便,不需要使用有毒的苯酚、氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀。获得的质粒产量高、纯度好, 可以直接用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序等各种分子生物学实验。
- 注意事项
- 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。
- 提取质粒的量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。一般高拷贝质粒,建议接种单菌落于1.5-5 ml加合适抗生素的LB培养基,过夜培养14-16个小时,可提取出高达30-50µg的纯净质粒。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒,应适当加大菌体使用量,使用5-10 ml过夜培养物,同时按比例增加P1、P2、N3的用量,其它步骤相同。
- 得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260值为1相当于大约50μg/ml DNA。电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA条带,这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。
- 质粒DNA确切分子大小, 必须酶切线性化后,对比DNA分子量Marker才可以知道。处于环状或者超螺旋状态的的质粒,泳动位置不确定,无法通过电泳知道其确切大小。
- 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20℃。质粒DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
- 关于平衡液的使用
- 介绍:核酸吸附硅胶膜柱子长期放置过程中会同空气中的电荷/尘埃发生反应而影响其核酸的结合能力。硅胶柱经平衡液预处理后可大大减少柱子中硅胶膜的憎水基团,提高核酸的结合能力。从而提高硅胶柱子回收效率或者产量。平衡液是强碱性溶液,若不小心碰到,请用大量自来水清洗。用完后需盖紧瓶盖,以免接触空气。室温保存。在保存过程中可能有沉淀生成,请加热至37℃使沉淀完全消失。
- 使用方法:取一个新的硅胶膜吸附柱子装在收集管中,吸取100μl的平衡液至柱子中。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中废液,将吸附柱子重新放回收集管。此时平衡液预处理柱子完毕。接后续的操作步骤。
- 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:
- 第一次使用前请先在漂洗液WB瓶和去蛋白液PE瓶中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
- 将RNase A全部加入溶液P1中,混匀,每次使用后置于2-8℃保存。
- 取1.5-5 ml过夜培养的菌液,12,000 rpm离心30秒,尽可能的倒干上清,收集菌体。
收集超过1.5 ml菌液, 可以离心弃上清后,在同一个1.5ml管内加入更多的菌液,重复步骤1,直到收集到足够的菌体。
- 用250 μl溶液P1重悬菌体沉淀,涡旋振荡至彻底悬浮。
如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
- 加250 μl的溶液P2,温和地上下翻转6 -8次使菌体充分裂解,室温放置4分钟。
温和地混合,不要剧烈震荡,以免基因组DNA剪切断裂!所用时间不应超过5分钟!以免质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要准确的5分钟。
- 加250 μl溶液N3,立即温和地上下翻转6 -8次,充分混匀时会出现白色絮状沉淀。12,000 rpm离心10分钟,小心取上清至新管,避免吸取到漂浮白色沉淀。
加入溶液N3后应该立即混匀,以免产生SDS的局部沉淀。
平衡液预处理吸附柱:
使用平衡液预处理硅胶膜吸附柱为必做步骤,具体方法参见前文“关于平衡液的使用”
- 向上清中加入0.5体积异丙醇(约335 µl)后充分颠倒混匀后分两次(每次不超过700 µl)转入吸附柱AC中(吸附柱放入收集管中),12,000 rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。直到所有混合溶液通过此吸附柱。
- 可选步骤:加入500 μl去蛋白液PE,12,000 rpm 离心30秒,弃废液。
此步骤为了去除痕量核酸酶等杂质,如所用菌株为JM系列、HB101等endA菌株或野生型菌株,核酸酶含量丰富,应加此步骤;如所用菌株为XL-1 Blue、Top10和DH5α等缺陷型菌株,核酸酶含量低,则可略过此步骤。
- 加入600 μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。再加入600μl漂洗液WB,重复漂洗一次。
- 将吸附柱AC放回空收集管中,12,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
- 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加50-100μl洗脱缓冲液EB,室温放置2分钟,12,000 rpm 离心1分钟。如果需要较多量质粒,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,离心1分钟。
洗脱体积越大,洗脱效率越高。如果需要质粒浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于30 μl,体积过小降低质粒洗脱效率,减少质粒产量。